Palgatoetus ja juhendamise toetus kujutavad endast valitsusepoolset ettevõtte tegevuskulude sihtfinantseerimist ning need summad ei ole käibemaksuseaduse mõistes käive. Seetõttu ei ole neid vaja kajastada ka KMD-l.
Mis puutub palgatoetusesse, siis maksab tööandja palgamaksud reaalselt väljamakselt (palgalt), mida töötajale makstakse - kõik palgamaksud arvestatakse ja peetakse kinni tavareeglitele vastavalt. Palgatoetus laekub firma pangakontole pärast töötasu arvestamist/maksmist ning toetuse summa maksuarvestuses ei kajastu. Ettevõtte tegevuskulude sihtfinantseerimise (nt palgatoetus, juhendamise toetus) kajastamise puhul raamatupidamises on võimalik kaks varianti:
- kasumiaruandes kas "muu tulu" all või;
- vähendatakse vastavaid kulusid (palgatoetuse puhul palgakulu vähendamine).
Mõlemad meetodid on vastavalt Komisjoni määrusele (EÜ) nr 1126/2008 aktsepteeritavad.