Sisendkäibemaksu osaline mahaarvamine on sätestatud KMS §-des 32 ja 33 ning rahandusministri 30.03.2004 määruses nr 39.
Sisendkäibemaksu osalisel mahaarvamisel lähtutakse maksukohustuslase Eestis ja välisriigis kalendriaasta jooksul tekkinud käibe, mille sisendkäibemaks on KMS § 29 lõike 1 alusel mahaarvatav, ning kogu tema Eestis ja välisriigis tekkinud käibe suhtest (maksustatava käibe ja kogu käibe suhe; KMS § 32 lg 1).
Oluline on lisada, et maksustatava käibe ja kogu käibe suhte arvutamisel ei võeta arvesse põhivara võõrandamist, kaasa arvatud juhul, kui maksukohustuslane on KMS § 16 lõike 3 kohaselt kauba maksustatavale väärtusele käibemaksu lisanud. Samuti ei võeta arvesse juhuslikku KMS § 16 lõike 2 punktis 6 ja lõikes 2.1 nimetatud teenuste osutamist ega juhuslikku kinnisasja kaubana võõrandamist (KMS § 32 lg 2).
KMS § 33 lõike 3 kohaselt arvatakse nii maksustatava kui ka maksuvaba käibe tarbeks soetatud kauba või saadud teenuse sisendkäibemaks maha vastavalt maksustatava käibe ja kogu käibe suhtele KMS § 33 lõikes 2 sätestatud korras, st maksustatava käibe ja kogu käibe suhe määratakse maksukohustuslase eelmise kalendriaasta käibe põhjal ning tulemust korrigeeritakse kalendriaasta lõpul, lähtudes selle kalendriaasta maksustatava käibe ja kogu käibe suhtest.
Seega tulenevalt eeltoodust tuleb proportsiooni (maksustatava käibe ja kogu käibe suhe) arvutamisel lähtuda kalendriaastast ning ümberarvestus nn üldarvete osas tuleb teha detsembrikuu KMD-l (tähtaeg 20.01.2012).
Täiendav info sisendkäibemaksu osalise mahaarvamise kohta on kättesaadav MTA kodulehe aadressil: http://www.emta.ee/index.php?id=28455#14.3.6